Hola Querubin, se me ocurren dos formas:
1ª Que el lago tenga una segunda salida conectada a una electroválvula, la cual al abrirse según el programador, mande el agua a otro depósito y más tarde en otra fase del programador envíe orden a un segundo motor para sacar esta agua y devolverla al lago, mar o lo que quieras hacer.
2ª Más facil, se podría hacer que del lago salga un riachuelo o calnal pequeño (acequia), mientras la bomba funciona, el nivel está alto, cuando la bomba deja de funcionar el nivel baja (se llena el depósito), es decir, montar el rio al revés, en vez que el rio desmboque en un lago, que sea este el nacimiento de un rio.