Yo creo, que lo primero debería de saber es que tipo de belén quieres, es decir, uno abierto o uno cerrado. El abierto será aquel que siempre hemos montado en casa, todo encima del mueble y punto, y el cerrado, digamos que es visto a través de un marco y solo se observa lo que el interior nos permite.
Segundo será conocer el tamaño de tus figuras e incluso como son, por ejemplo, si tienes un herrero se podría plantear una herrería, si tienes algún pastor y ovejas se podría hacer un camino con el pastor y las ovejas.
Ahora deberías de replantearte que quieres escenificar, es decir, si solo quieres el nacimiento, nacimiento y la anunciación, nacimiento y huida a egipto, por poner ejemplos.
Una vez tengamos todo eso (el primero tú), será más fácil planificar que es lo que te gustaría a ti.