Hola Antonio, esto puede ser sencillo o muy complejo según sepas sobre la materia...te explico sobre la marcha lo mejor que pueda...
Primero tienes que tomar referencias basicas reales para llevarlas a tus edificaciones para construirla con proporción a tus figuras: 40cms. medida de tus figuras para realizar el belén, ahora tienes que saber lo que medirá en la realidad por ejemplo tu San José, (si quieres ser exhaustivo tendrías que investigar la altura media de la poblacion en esa época) pongamos que fuera 1,70 m.
Pues la proporcion entre la realidad y lo representado sería dividir 170cms entre los 40cms de tu figura, sería 4,25cms, SJose sería aprox. cuatro veces mayor que tu figura.
Para poder llevarlo a las edificaciones tendrás que tener una escala que este caso es 1:4,25 que significa que por cada centímetro de edificación(maqueta) corresponde a 4,25 centimetro de la realidad.
Tambien tendrás que saber las medidas basicas de los elementos de las construcciones, por ejemplo la altura de una puerta, pongamos 1,90m. tendrás que dividir 190/4,25=44,7cms, si haces una comprobación rápida por ahora es correcto, tu SJose pasaría por la puerta es de 40cms de alto.

Lo más adecuado y mejor para construir tus edificaciones es que te hicieras una escala gráfica, hacerte tu propio excalimetro, tu propia regla con la escala del ejemplo 1:4,25 para no estar todo el tiempo con la calculadora...

Hay muchos ejemplos en internet de como hacerla, por ejemplo con una cartulina, 20 o 30 cms de largo y ponle unos 5/7cms de ancho y a lo largo del borde marcas tu escala. Bueno es un poco tarde si no te aclaras con la escala gráfica ya lo vemos en otro momento, espero que te sirva...

También puedes instalarte en el movil la aplicación llamada Hobby color converter, con ella solo tienes que poner la escala a la que vas a trabajar y el tamaño real de los objetos y el ya te dice el tamaño que debe tener en la maqueta.